На первом месте для него дети, затем — любимая работа. При этом Аффлек не зарекается: он открыт новым событиям и не исключает, что когда-нибудь в его жизни снова появится любовь, но форсировать события не собирается.
У Аффлека трое детей от бывшей жены Дженнифер Гарнер — 20-летняя Вайолет, 17-летний Фин и 14-летний Сэмюэл. С Дженнифер Лопес актер вновь сошелся в 2021 году — почти через два десятилетия после того, как закончился их первый роман. В июле 2022-го они поженились в Лас-Вегасе, а через месяц устроили большую свадебную церемонию в Джорджии. Спустя два года Лопес подала на развод, который окончательно оформили в начале 2025 года.
Несмотря на расставание, бывшие супруги сохранили хорошие отношения и продолжили сотрудничать. Ранее Аффлек очень тепло отзывался о Лопес, отмечая, что она прекрасно ладит с его детьми и по-прежнему остается важным для них человеком. Он также говорил, что любит ее детей и очень ценит саму Дженнифер.
При этом собственные дети Аффлека, судя по всему, не считают отца большим специалистом по романтическим отношениям. Актер с юмором рассказывал, что, когда пытается дать им совет, подростки тут же напоминают о его собственном опыте. По словам Аффлека, раньше он считал себя «крутым папой», а теперь замечает, как дети переглядываются за столом, стоит ему начать очередную воспитательную речь.
С Дженнифер Гарнер у актера тоже сохранились близкие дружеские отношения. Изначально она должна была сниматься вместе с ним в «Животных», однако позже от этой идеи отказались, решив, что их реальная история может слишком отвлекать зрителей. Сам Аффлек говорит, что с удовольствием поработал бы с Гарнер в будущем: он высоко ценит ее как актрису и очень дорожит их дружбой.
